45 лет Мишкинис руководит всемирно знаменитым вильнюсским хором мальчиков «Ажуолюкас» («Дубок»), воспитанником которого сам был в 60-е годы. Своим подвижническим трудом Витаутас Мишкинис поддерживает и развивает традиции хорового искусства Литвы, где это искусство является национальным достоянием, объединяющим и скрепляющим нацию.

Витаутас Мишкинис родился 5 июня 1954. В 1976 окончил Вильнюсскую консерваторию по хоровому дирижированию у проф. Германа Перельштейнаса. В 1975–1979 — дирижер Каунасского государственного хора и вокального ансамбля Museum Musicum.

В хоре «Ажуолюкас» пел с 7 лет. В 1979 в возрасте 25 лет стал его художественным руководителем. Под руководством Мишкиниса хор «Ажуолюкас» участвовал в песенных фестивалях, стал лауреатом многих национальных и международных фестивалей и конкурсов: в Марктобердорфе, Бохуме и Майнхойзене (Германия), Гориции и Ареццо (Италия), Варне (Болгария), Мариборе и Любляне (Словения), Тампере (Финляндия), Нанте (Франция), Толосе (Испания).

В репертуаре коллектива — опера Перселла «Дидона и Эней», кантаты Баха, оратории Генделя «Иуда Маккавей» и «Бальтазар», «Коронационная месса» и Реквием Моцарта, Реквием Керубини, драматическая симфония «Осуждение Фауста» , Берлиоза «Глория» Пуленка, Вторая, Третья и Восьмая симфонии Малера, «Военный реквием» Бриттена, ода «Создатели музыки» Элгара, оратория «Жанна д’Арк на костре» Онеггера, «Симфония псалмов» Стравинского, кантата  «Александр Невский» Прокофьева, «Кармина Бурана» Орфа, произведения литовских композиторов. Хор делал записи для радио Литвы и других стран, записывался на грампластинки и CD, участвовал в телепередачах, фильмах и музыкальных спектаклях.

В 1970-х–1980-х гг. Мишкинис активно сотрудничал с Комиссией по эстетическому воспитанию детей и юношества Союза композиторов СССР, в которой работали Борис Диментман и Петр Меркурьев, основатели газеты «Музыкальное обозрение».

С 1991 года Витаутас Мишкинис — художественный руководитель вокального ансамбля «Museum musicum» в Вильнюсе.

Член жюри и консультант многочисленных хоровых конкурсов, фестивалей, олимпиад, хоровых игр: в Таллинне и Тарту (Эстония), Риге (Латвия), Будапеште и Дебрецене (Венгрия), Бергене (Норвегия), Нойшателе (Швейцария), Нерпельте, Кортрейке и Аалсте (Бельгия), Маниле (Филиппины), Сувалках (Польша), По и Туре (Франция); хоровых Олимпиад в Линце (Австрия), Пусане (Корея), Бремене (Германия), Сямыне и Шаосине (Китай) (всего около 200).

Как дирижер, Мишкинис гастролировал в странах Европы, США, Канаде, Японии. Читает лекции, проводит семинары и мастер-классы по музыкальному образованию и дирижированию в Литве, Латвии, России, Украине, Чехии, Словении, Испании, Польше, Италии, США, Японии, Корее, Китае, Гонконге, Сингапуре, на Филиппинах, Тайване и других странах.

С 1985 преподает в Литовской Академии музыки и театра, с 2002 профессор по классу хорового дирижирования.

С 1995 — президент Хорового Союза Литвы.

С 1980 Мишкинис дирижирует и руководит хором на литовских Праздниках песни. С 1990 — художественный руководитель и главный дирижер Праздников песни. Он — главный дирижер Первого (1994) и Второго (1998) Всемирных песенных фестивалей Литвы, детских песенных и художественных фестивалей в Литве.

С 2000 — консультант Europa Cantat (Европейской юношеской хоровой федерации). С 2002 — почетный член ACDA (Американской ассоциации руководителей хоров) и член IFCM (Международной федерации хоровой музыки).

С 2004 — член Совета директоров Всемирных хоровых Олимпийских игр.

Член Хорового союза Литвы, Союза композиторов, Союза музыкальных деятелей Литвы.

Витаутас Мишкинис —автор около 800 произведений для хора: 400 духовных сочинений a’cappella, 20 месс, Магнификата, «Страстей по Иоанну», нескольких кантат, мюзикла, оперы, более 400 песен (в основном для детского хора), которые исполняются в Литве, странах Европы и Америки.

Чутко прислушиваясь к композиторским тенденциям наших дней, Мишкинис обращает особое внимание на возраст и возможности исполнителей, для которых пишет. Для его произведений характерна тесная связь между музыкой и текстом (в основном он использует латинские тексты), гомофонная фактура с ярко выраженной мелодией и гармонической тканью, элементами полифонии, использованием алеаторики, сонорных эффектов.

Его произведения записаны на CD многими литовскими и зарубежными хорами, изданы во Франции, Германии, Италии, Испании, США, Латвии, Словении, Сингапуре, Японии.

Витаутас Мишкинис — заслуженный артист Литвы. Лауреат Государственной премии Правительства Литвы, награжден Крестом Офицера ордена Великого князя Литовского Гедиминаса, почетным знаком Министерства культуры Литвы «Неси свой свет и верь», высшей наградой г. Вильнюса — медалью Сигизмунда Августа. Дважды удостоен звания «Автор года».